The World Ends with You The Animation - Neku Sakuraba, seorang anak laki-laki berusia 15 tahun dengan hobi musik dan grafiti, terbangun di tempat yang tampaknya merupakan distrik perbelanjaan Shibuya di Tokyo, Jepang. Tanpa tahu mengapa dia ada di sana, dia membuka tangannya untuk menyadari bahwa dia memegang peniti hitam yang aneh. Setelah membaliknya dengan tangannya, pikiran orang-orang di sekitarnya mulai mengalir ke kepalanya sekaligus. Terkejut, Neku menemukan dia bisa membaca pikiran orang lain dan menganggap itu ada hubungannya dengan pin hitam yang dia pegang.
