Cross Academy adalah sekolah asrama elit dengan dua kelas terpisah, terisolasi: Kelas Siang dan Kelas Malam. Di permukaan, Yuuki Cross dan Zero Kiryuu adalah prefek akademi, dan berusaha menjaga ketertiban di antara para siswa ketika kelas-kelas berputar di malam hari. Karena Kelas Malam penuh dengan elit yang sangat cantik, ini kadang-kadang terbukti agak sulit. Ini benar-benar diperlukan, karena "elit" itu sebenarnya adalah vampir. Yuuki dan Zero bertindak sebagai wali, melindungi rahasia Kelas Malam dan keselamatan rekan-rekan mereka di pagi hari yang bodoh.Sebagai putri angkat ketua akademi, Yuuki mengambil pekerjaannya dengan sikap yang serius dan bersemangat. Ini juga memungkinkan dia untuk berinteraksi dengan orang yang disukainya dan penyelamat rahasia, presiden asrama siswa Malam, Kaname Kuran. Zero, di sisi lain, memiliki kebencian yang mengakar terhadap vampir, dan kadang-kadang, tidak ragu untuk membunuh.Bisakah vampir dan manusia hidup berdampingan, bahkan dalam pengaturan ketat Akademi Silang? Hanya waktu yang akan memberitahu.
